Detalle del Docente 2016-12-06T16:49:11+00:00

Smircich Ruzo, Pablo Christian

DATOS PERSONALES Y ACADÉMICOS

Grado y Servicio

Grado 3 / Facultad de Ciencias / Departamento de Genética
Grado 2 / Facultad de Medicina / Departamento de Genética

Contacto

Email: psmircich@fcien.edu.uy / Teléfono: 096868164

Área disciplinar

Básica

Disciplina / Subdisciplina

Biología Molecular / Genómica y Bioinformática

Mayor nivel académico

Doctorado, PEDECIBA (año 2013)

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Pertenece al SNI

Si pertenece / Nivel I

Pertenece al PEDECIBA

Si pertenece / Grado 3

DATOS DEL PROYECTO DE DEDICACIÓN TOTAL

Título del Plan de Actividades

Genómica y bioinformática en parásitos de importancia sanitaria

Palabras clave

Parasitología molecular, Genómica, Bioinformática, Expresión Génica

Resumen Publicable

Las infecciones parasitarias persisten como un grave problema a escala mundial, y es de fundamental interés comprender su biología. En los últimos años la genómica nos ha permitido hacernos preguntas a nivel global. La bioinformática se ha convertido en una herramienta esencial para la interpretación a fondo de los datos generados por estas estrategias. Mi trabajo se ha desarrollado en laboratorios correspondientes a dos centros universitarios. La propuesta de investigación presente tiene como objetivo el estudio a nivel genómico utilizando fundamentalmente herramientas de bioinformática de dos grupos de organismos parásitos diferentes, que son objeto de estudio en cada uno de los laboratorios mencionados anteriormente. En el caso de los parásitos platelmintos, los estudios genómicos están siendo desarrollados desde hace poco tiempo, generándose solo recientemente datos de este tipo. Por lo tanto, en este momento nos estamos centrando en comprender de manera inicial la estructura genómica de estos organismos. Haciendo uso de datos producidos por nuestro grupo hemos encontrado características diferenciales de composición de codones y aminoácidos en los genomas de los helmintos cuando estos son comparados a los genomas de los modelos de este grupo de organismos. Nuestra propuesta actual busca ahondar en estos estudios composicionales centrándonos en entender las características específicas de composición para cada especie y realizar estudios comparativos.
En el caso de los tripanosomátidos los estudios genómicos tienen mayor desarrollo y contamos con genomas completos para varios representantes del grupo. Esto nos he permitido realizar estudios de genómica comparada en estos organismos, centrándonos en encontrar señales funcionales en los genomas. Dado que estos organismos tienen la particularidad de no poseer señales de secuencia conservada, nos hemos enfocado al estudio de las estructuras secundarias del ADN. Con esta aproximación hemos encontrando que las regiones de alta curvatura intrínseca colocalizan con regiones que poseen características epigenéticas relevantes para el inicio transcripcional. Actualmente buscamos continuar con esta caracterización estructural de los genomas de los tripanosomátidos modelo.

Grado y Fecha de Ingreso al RDT

Grado 2 / Desde: 2014-04-01

Programa: Científico Proveniente del Exterior

El cargo NO se enmarca en este programa

Participa de Grupo Autoidentificado

Grupos: 881416
108725
1066

Observaciones

DOCUMENTACIÓN ADJUNTA

Curriculum Vitae

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